Zwilling was een kloostergenoot van Luther en werkte in 1521 en '22 krachtig mede aan de omzetting van de eredienst te Wittenberg en omgeving door tegen de Mis te prediken en het Avondmaal persoonlijk en onder beide gestalten uit te reiken. Hij is een van de aanstichters van de beeldenstorm te Wittenberg geweest maar ging snel over in de meer geleidelijke sporen, zoals Luther die wenste. Om zijn verzet tegen het Interim is Zwilling in 1549 als superintendent te Torgau afgezet.