Koopman werd internationaal bekend als vertegenwoordiger van de naar authenticiteit strevende barokmusici. In 1979 richtte hij het door hemzelf gedirigeerde Amsterdam Baroque Orchestra op, waarmee hij ook opera-producties verzorgde. Vanaf 1994 legde hij de cantates van J.S. Bach op cd vast. Ook heeft  hij in Japan met zijn elite-orkest alle Mozart-symfonieën opgenomen op cd-video.

Zeventig uur in een zevendaagse werkweek spreken voor Ton Koopman, die vol ideeën zit, vanzelf. Naast de oude partituren in zijn huis in Bussum, dat met verscheidene  klavecimbels een klein  instrumentenmuseum is (zijn vrouw Tiny Mathot is een gewaardeerd klaveciniste) stapelen zich de microfilms en  fotokopieën op. Ook als organist houdt Koopman van historische  instrumenten., Bijzondere waardering heeft hij voor het Arp Schniger-orgel in Norden en voor het orgel in de Hamburgse Jacobikerk.